Berdasarkan PERMA Nomor 7 Tahun 2015 Pasal 323 Kesekretariatan Pengadilan Agama Banggai Kelas II mempunyai tugas melaksanakan pemberian dukungan di bidang administrasi, organisasi, keuangan, sumber daya manusia, serta sarana dan prasarana di lingkungan Pengadilan Agama Banggai.

• Penyiapan bahan pelaksanaan urusan perencanaan program dan anggaran
• Pelaksanaan urusan kepegawaian, Keuangan, Penyiapan Bahan Pelaksanaan Penataan Organisasi dan Tata Laksana, Pelaksanaan Pengelolaan Teknologi Informasi dan Statistik;
• Pelaksanaan Urusan Surat menyurat, Arsip, Perlengkapan, Rumah Tangga, Keamanan, Keprotokolan, dan Perpustakaan; dan
• Penyiapan Bahan Pelaksanaan Pemantauan, Evaluasi dan Dokumentasi serta Pelaporan di Lingkungan Kesekretariatan Pengadilan Agama Banggai Kelas II

Pengadilan Agama merupakan Pengadilan Tingkat Pertama yang bertugas dan berwenang memeriksa, memutus, dan menyelesaikan perkara di tingkat pertama antara orang-orang yang beragama Islam di bidang:

• Perkawinan
• Kewarisan
• Wasiat dan hibah berdasarkan hukum Islam
• Wakaf dan shadaqah

Dasar hukum: Pasal 49 Undang-Undang Nomor 50 Tahun 2010 tentang Peradilan Agama.

Untuk melaksanakan tugas pokok, Pengadilan Agama memiliki fungsi sebagai berikut:

1. Memberikan pelayanan teknis yustisial dan administrasi kepaniteraan bagi perkara tingkat pertama, termasuk penyitaan dan eksekusi.
2. Memberikan pelayanan administrasi perkara banding, kasasi, dan peninjauan kembali.
3. Memberikan pelayanan administrasi umum kepada semua unsur di lingkungan Pengadilan Agama (umum, kepegawaian, dan keuangan kecuali biaya perkara).
4. Memberikan keterangan, pertimbangan, dan nasihat hukum Islam kepada instansi pemerintah sesuai Pasal 52 UU Nomor 50 Tahun 2010.
5. Menyelesaikan permohonan pembagian harta peninggalan di luar sengketa sesuai Pasal 107 ayat 2 UU Nomor 3 Tahun 2006.
6. Waarmerking akta keahliwarisan untuk keperluan seperti pengambilan deposito/tabungan atau pensiun.
7. Melaksanakan tugas pelayanan lain, seperti:
   • Penyuluhan hukum
   • Pelaksanaan hisab rukyat
   • Pelayanan riset/penelitian.